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技术宝典— 样本处理
热门技术揭秘:TRIzol法提取RNA,打造RNA研究的必备神器!

 

 

 



热门技术揭秘:TRIzol法提取RNA,打造RNA研究的必备神器!


Trlzol


TRIzol法提取RNA可用于人类、动物、植物、微生物的组织或培养细菌,样品量从毫克到几克,提取出的RNA不会存在DNA和蛋白质的污染,提取出的RNA可直接用于RT-PCR、Northern斑点分析、斑点杂交、Dot blot、RNase 保护分析等。整个实验流程大致可分为匀浆裂解样本、溶液相分离、RNA沉淀、RNA清洗、RNA重溶。具体操作可以从本公司官网或者往期文章查看哦~本文不具体撰述。



TRIzol

.01


图片1.png

胰腺组织样本中trizol数据对比

Figure1 

红色扩增曲线是小鼠胰腺组织取完材,室温加trizol(浸没组织) 15分钟后(充分渗透)冻入=-80度冰箱(温度很重要)的CT值。

绿色扩增曲线是小鼠胰腺组织取完材,室温加trizol(浸没组织) 立即冻入-80度冰箱(温度很重要)的CT值。

结论:用trizol充分浸没组织样本并充分渗透组织有利于保护样本抑制RNA酶的活性,避免RNA的降解。

   

Q

小T老师,我们现在组织抽提RNA都不用trizol了,都用快速提取试剂盒了(柱式抽提或者磁珠),还需要trizol么?

A

trizol保护的组织不影响快速抽提方式,我们把组织取出即可。继续使用快速抽提方式

 

TRIzol

 

1-溴-3-氯丙烷替代 氯仿(三氯甲烷)可能性

.02


分子式为CH2BrCH2CH2CL,分子量为157.44,密度1.592 g/cm³(氯仿1.48 g/cm³)无色透明的液体,不溶于水,溶于乙醇、醚及氯仿。1-溴-3-氯丙烷可以替代氯仿使溶液相分离,优点是毒性比氯仿要小,上下分相更加的清晰,对于上清的吸取更加的方便,其起到的作用也与氯仿相同,主要是::

1、可以与TRIzol中的8-羟基喹啉共同作用,使蛋白质变性,蛋白质变性后,可通过离心沉淀去除,还可以起到抑制RNA酶的作用。

2、TRIzol试剂中含有大量的苯酚,而苯酚是微溶于水的,在分液时水相里会含有少量的苯酚,而苯酚不去除的话会破坏核酸,1-溴-3-氯丙烷就可以将水相里的苯酚去除掉

3、样本在抽提的过程中会存在一些脂溶性杂质,1-溴-3-氯丙烷就可以起到一定的去除杂质的作用

Q

小T老师,买不到氯仿怎么办???

A

放心大胆的用1-溴-3-氯丙烷(小T老师做QPCR已经用了5年了)

图片2.png

1-溴-3-氯丙烷(前16孔)与氯仿数据对比

1-溴-3-氯丙烷

 

异丙醇

.03


异丙醇英文名为IPA,分子式为C3H8O,分子量60.06,无色透明液体,溶于水,也溶于醇、醚、苯、氯仿等多数有机溶剂。异丙醇属于有机溶剂,可以和RNA抢水,破坏RNA中的水化层,使RNA沉淀,还可以去除核酸中的蛋白质和多糖的污染

异丙醇

 

75%的乙醇(DEPC水稀释)

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在RNA沉淀过程中,我们已经将RNA变成固体析了出来,但是此时RNA的表面还沾有一些其他的杂质,所以我们这个时候就可以使用75%的乙醇进行清洗。由于RNA溶解性是易溶于水,不溶于有机溶剂,所以75%的乙醇既可以使RNA保持固体状态,少量的水还可以去除RNA表面的杂质,最后可以获得比较纯的RNA。

75%的乙醇(DEPC水稀释)

 

DEPC水

.05


DEPC水用于稀释乙醇和RNA的重溶,使RNA由固体变为液体状态,为什么要使用DEPC水进行RNA的溶解呢?那是因为DEPC是一种RNA酶抑制剂,可以抑制RNA酶的活性,以便获得质量更好的RNA。

DEPC水

 

 

 

 

 

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