MiRNA因为已经研究得比较烂了，所以现有很多个网站是可以进行MiRNA的Target预测的，但具体预测的效果怎么样，就参差不齐了。我们采用的办法就是简单的交集法。说简单点，其实就是把几个网站上预测出来的Target基因导出到Excel上，来取交集。所以我说这是个体力活……

比较有名的MiRNA靶基因预测的网站有这样几个，首先就是TargetScan，这个网站包含了大量的MiRNA的靶基因的预测，但有一点，有可能会搜出你未必需要的MiRNA的靶基因，需要到Excel里去筛选一下。输入的时候，需要输入Mir-，以表示是人的MiRNA。

其次比较常用的PicTar（http://pictar.mdc-berlin.de/），其实也是一个数据库类型的网站，也可以预测MiRNA的靶基因。下拉菜单中选出MiRNA的名字，点击“search for Target of MiRNA”即可。

后不得不提的是MiRanda（http://www.microrna.org/microrna/home.do），其实是一个网页版的应用，也可以搜出大量的MiRNA的靶基因。