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技术宝典— qPCR
qPCR 基因篇(2)-------如何查找基因

 要怎么搜Actin这个基因。

 

点开NCBI的Gene,然后,输入你觉得是这个基因的名字:βActin,然后:

 

 

好吧,看到这里我们发觉,起码好歹真的有叫β Actin的基因,但怎么说呢,反正不是人的就对了。

 

那我们找是人的,好啦,旁边有工具,显示:

 

 

人么,就是这个Homo Sapiens,点进去还有48个基因,尼玛到底是哪个呢?

 

 

仔细看描述一栏,也就是Description,中间有一个是描述成actin,beta的,这个基因名(Symbol)应该是ACTB。而不是我们通常说的β Actin

 


 

Symbol是基因的名称,在文献是可以经常看到的,经常会提到某个基因的基因名。我们就可以用Symbol在NCBI的Gene数据库搜索。但有一点需注意,Symbol是经常会改变的,就是说随着序列的升级,对该基因的研究更加深入,Symbol会改变。但这个基本上不会影响使用,因为NCBI仍然会保留旧的基因名。用旧的Symbol在Gene数据库搜索同样有效。

 

我们打开β Actin的Gene页面,抱歉,应该是ACTB。然后可以看到这样的信息,ATCB到底有多少种名字。这里有ACTB的官方基因名,官方全名也就是俗名,基因ID号(这个在做GO分析的时候很重要),还有该基因的别名。

 

 

是光这点基因名称就Over了么?还么有辣么简单,你会看到NC_0000000NG_000000,NM_000000这样一系列的编码。这又特么是什么呢?

 

这是NCBI上对于基因注释的参考序列编码,我们稍微解释一下,基本上是这样的:

 

 

按照下面这个表格上的注释编码,就可以找到你想要的基因序列了。


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