PCR Array 技术也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列，它结合了Real Time PCR技术的高灵敏性和高特异性和微阵列技术可以同时检测多个基因的优势，是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。

芯片上的基因包括了与研究对象有确定关系的基因，或至少是与研究对象的关系有待考证的基因，如果研究对象是某一生物学通路的基因，则使用针对该类基因的功能分类基因芯片比使用高密度表达谱芯片更加有效便利。在一张96孔或384孔板上可同时对某个信号通路或某生物学功能相关的370个重要基因的表达量变化进行检测（其余为对照样本孔），为实验研究者节省了大量预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程，可以直接明了的了解不同课题研究中某信号通路或疾病中关键基因的表达谱。

PCR Array 原理：

PCR Arrays是分析一组特定基因表达的可靠工具，引物经过优化。每个96孔板、384孔板PCR Array都包含SYBR® Green优化的引物分析，可对相关的通路或疾病相关的基因进行细致的研究，并含有相应的RNA、DNA质量控制。PCR Arrays也可针对您特定的研究兴趣对一些基因作定制化分析。高品质引物设计和qPCR Master mix使PCRArray可在统一的循环条件下同时扩增96或384个不同的基因特异性产物。

    PCR Arrays进行的基因表达分析具有real-time PCR的灵敏度和微阵列的多基因检测能力。这种整合使PCR Array具有高特异性和扩增效率，可获得准确的SYBR® Green real-time PCR结果。PCR芯片在任何研究实验室都易于使用。PCR Arrays具有足够高的敏感度，可使用从常规样本（0.1–5 µg RNA）、FFPE样本和小样本（1–100 ng RNA）制备的RNA。

PCR Array 性能优势：

灵敏度：

每个芯片使用至少1 ng或至多5 µg总RNA可获得高于80%的阳性信号率，即使细胞中细胞因子的表达量很低，25 ng总RNA的阳性率也>80%。

重复性：

图为对比不同研究人员在间隔3个月的时间下使用不同批次的Human Drug Metabolism PCR Arrays芯片所得到的重复结果，计算两次CT值结果的相关系数，分别为0.995 +0.001和 0.998 +0.000。

特异性：

PCR Array体系使用高品质RNA，可在预期位置形成单条带，无引物二聚体或其他二级产物，由此可获得高度准确的real-time PCR结果。

统一的PCR扩增效率：

对多种样本的多个基因进行准确的基因表达比较，需要PCR芯片技术具有统一的PCR扩增效率。将专有的引物设计法则与严格的引物分析检测相结合，确保PCR芯片的每次引物分析都具有高性能。

PCR芯片能够获得高度准确的结果：使用PCR Arrays对多基因进行分析，在99%的置信区间内，PCR的扩增效率在90%-110%之间，持续的高扩增效率确保PCR芯片能够使用ΔΔCT法准确的分析多种基因。