1.检查仪器及试剂
检查各仪器是否完好可用,各试剂是否在使用期限内,各耗材是否准备充分。
2. 样本前处理及蛋白定量
将保存好的样本(注意避免反复冻融)取出,用剪刀和镊子将其剪成实验所需大小,置于离心管中,在管壁上标识样本名称,注意取不同样本时的取样工具要在PBS中清洗,避免交叉污染,在天平上称量样品重量,记录,根据所称重量加入5倍体积的单去污裂解液,用电动匀浆机进行匀浆,在匀浆不同样本时要在PBS中清洗,避免交叉污染,匀浆后在离心机中12000转离心15分钟,取上清液测定蛋白浓度,(注意要尽快测蛋白浓度防止降解),测定用BCA试剂盒,做法依说明书所示。
3. 蛋白变性
将测好蛋白浓度的样本进行均一化处理,按照测量蛋白浓度的结果,以样本中小蛋白含量为参照值,拉平所有样本蛋白浓度,计算在16ul体系下需要加的样本和补足的缓冲液的体积数,(若需要多次试验则准备160ul体系的各体积数),置于90℃金属浴中15分钟。变性结束后,及时保存好样本,供后续试验使用。
4. 电泳
4.1配胶
将配胶用的玻璃板置于有洗涤剂的清水中(每周一换)用棉条轻轻擦拭(不可用布,防止划伤玻璃),洗好后用清水冲干净,标准是在玻璃板面上有凝聚的水珠而非大滩的水渍,在操作台上铺一层纸巾,将两块玻璃板放在纸巾上,互相结合面朝上,用吹风机吹干板上水珠,若有残留,用纸巾将水珠点干,避免大面积擦拭划伤玻璃。
手持已经干燥的玻璃板,注意手持玻璃板边缘,将其重合好后,置于制胶器中,用楔子固定,注意观察两玻璃底面与制胶器底部是否水平,缝合良好,将做好的制胶器置于制胶架上,(制胶架擦拭干净),固定时将两侧的固定轴同时往里挤压,然后双手同时顺时针转动至所需标的角度上(1.0mm的胶转至1.0mm刻度以此类推),听到双手转至咔的一声,固定结束。
配置分离胶,按照试剂配置表,准备好相应的试剂,注意试剂的保存条件,配胶时要迅速,防止时间过长凝胶,若温度过低导致试剂沉淀,凝结,则需在37℃水浴中将其混合均匀,配好后,用900ul的枪在一面玻璃板上加5枪,注意加的时候要缓慢加,避免漏胶,避免混入气泡,然后用枪在板面各处滴加水滴压胶,至与板面水平,制好后等待20分钟以便凝胶,若温度过低,需要置于室温20℃环境中凝胶,或者延长凝胶时间。
将板面的水层倾倒,用滤纸吸干残留的水滴,注意不要和分离胶接触,以免发生粘连。配置浓缩胶要求同上,在配好后迅速插入上样梳,注意插好后不要太用力,等待凝胶时间和温度过低时处理方式亦同上。凝胶后一定要在制胶槽中充入电泳液再拔梳子,否则拔得时候上样孔会扭曲,拔梳子时,双手同时捏住梳子的两端,同时轻轻往上拔,用力要均匀一致,避免产生气泡,若拔的过程中,凝胶不好,可能是由于配浓缩胶所用AP或TEMD不准,需要重配,这一步一定很谨慎,否则做不好会导致重来浪费时间,后续的操作都要依次后推。
4.2上样
事先将每块胶的泳道上样的排版排好,一般一块胶上8个样本,不同客户的样本用loading隔开,若排不满15个泳道,其余空的泳道用loading隔开,一般样本上16ul体系,loading上4ul,marker上3ul体系,加样的时候,枪头注意不要插入上样槽很深,注意加样不要溢出。若上4块胶或更多时,要注意一定要等所有的胶全部制好才能上样,否则溴酚蓝在缓冲液中时间过长会导致溢出。
电泳,在电泳槽中充满电泳缓冲液,电泳液不要过满,注意接头处要保持干燥避免短路,电泳仪调至80v跑30-45分钟,待在浓缩胶中将蛋白拉到同一水平线上,转到120v,共跑一个半小时。注意要把marker分子量小的蛋白跑出来。有的电泳中蛋白阻力比较大,一个半小时可能还没有把分子量小的蛋白跑出来,要延长电泳时间,直到跑出。
5. 转膜
准备一个水槽,充入转膜缓冲液,将电泳结束后的电泳装置拆开,把玻璃板取出在清水下冲一下,双手抵住玻璃板将结合部位撬开,注意一定要动作柔和,防止胶碎,用小铲子将胶和玻璃贴合面轻轻划痕,把浓缩胶的部分弃掉,分离胶的部分用铲子轻轻铲出放在有转膜缓冲液的水槽中,取三张滤纸重叠好,浸入转膜缓冲液,取一张转膜的nc膜,注意用镊子取夹,避免接触到nc膜表面,浸入转膜缓冲液中,将胶按照上样的顺序平置于掌心中,上面垫一层nc膜,注意覆盖完全,再在上面一层垫三层滤纸,取一层浸了转膜缓冲液的棉垫,在胶的下层同样放置浸了转膜缓冲液的滤纸和棉垫,将“整个三明治 ”放在水槽中,用铲子水平赶走气泡,注意要记住胶在上面还是膜在上面,将胶的一面放在转膜夹的黑色一面,插好后充入转膜缓冲液,转膜电压60v,在4℃下转膜一个半小时。
6. 染膜
将转膜结束的装置拆开,用镊子取出nc膜,放入TBST中,其余棉垫清洗后回收使用,滤纸以及胶弃掉,胶有毒注意妥善处理。按照丽春红溶液:双蒸水1:10配置染膜溶液,混匀。用镊子夹取nc膜放入染膜溶液中浸没,三分钟后放入清水中清洗,观察染膜结果,目的蛋白是否在准确的位置上。用剪刀剪下目的蛋白区域的膜,注意要用镊子避免接触到蛋白,剪膜的时候注意避免接触到目的蛋白,在膜的边缘无蛋白区标识可识别的标志。
7. 封闭
脱脂牛奶0.5g,加到TBST 50ml中,现配现用,将剪好的nc膜放在封闭液中,注意不要将膜层叠在一起,在脱色摇床上以一定的速率进行封闭一个小时。
8. 一抗
将一抗按照说明书上的稀释比进行稀释,若预实验效果不好,进行梯度稀释,注意样本和抗体的种属是否匹配,注意抗体不要长时间置于外面,用完后及时将其放入冰箱中,将抗体从冰箱中取出,进行混匀离心,计算样本所需要的抗体量,用TBST进行稀释,稀释混匀注意不要用加样枪吹打避免产生气泡,抗体稀释液一般加2ml,将nc膜用镊子将有蛋白的一面孵到抗体稀释液中,放入4℃冰箱中过夜。
9. 洗脱
将孵育好的nc膜从孔槽中取出,放入装有TBST的平皿中,脱色摇床以固定转速清洗10分钟,三次。注意膜不要层叠在一起。
10. 二抗
将二抗从冰箱中取出,混匀离心,计算样本所需要抗体量。用TBST稀释,注意若按照稀释比,抗体的量少于1ul,则要按照至少1ul的量来计算所需的TBST的量,放入孔槽中孵育一个小时。因大多数样本的二抗是固定几种,因此计算中总的二抗需用量,在离心管中进行稀释,稀释时注意不要用加样枪进行吹打,避免产生气泡。
11. 洗脱
将孵育好的nc膜从孔槽中取出,放入装有TBST的平皿中,脱色摇床以固定转速清洗10分钟,三次。注意膜不要层叠在一起。
12. ECL显色
将显色液从冰箱拿出,注意避光,将A液,B液按照等体积混合,一般一张膜用量1ml,用枪均匀滴在膜表面,剪开一个自封袋,用镊子把膜平整放在自封袋中,压好,避免产生气泡,放在光片夹中。
13. 曝光
将装有nc膜的光片夹拿到暗室中,避免有任何的光源,在暗室灯中剪裁大小合适的胶片,层叠三张于nc膜上,压好,关上光片夹,计时20分钟,曝光后,在暗室将光片夹打开,放入显影液中静置3分钟后,放入定影液中清洗,此时曝光结束,出暗室,在清水下冲洗胶片。
14. 数据分析处理
将曝光好的胶片进行分析,对比marker,观察目的蛋白条带是否出现,背景是否干净,条带差异是否真实符合逻辑,观察内参条带是否均一,在预实验中摸清抗体的准确稀释比,样本是否可用,根据预实验得出的结论,安排下一步的正式试验,试验情况良好,用扫描仪扫描胶片,根据内参条带,计算灰度值,确定样本组间灰度值的差异。