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microRNA qPCR 实验服务
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BioTNT 五年QPCR microRNA QPCR  检测倾情服务!  优质服务品质回报社会!

BioTNT 生物技术服务部自从2005年成立以来,承接了超过200个QPCR microRNA 技术服务项目,积累了广泛的QPCR 定量检测的经验。 
 
一、简介: 关于microRNA
     MicroRNAs(miRNAs)是一种小的内源性非编码RNA分子,大约由21-25个核苷酸组成。这些小的miRNA通常靶向一个或者多个mRNA,通过翻译水平的抑制或断裂靶标mRNAs而调节基因的表达。成熟的microRNA 的形成包含多个步骤。首先,microRNA 基因被转录成命名为pri-microRNA 的初级转录物;动物pri-microRNA的第一次剪切位于细胞核内,产生大小为70个核苷酸左右并能形成茎-环结构的microRNA 前体,称为pre-microRNA;第二次剪切位于细胞质中,pre-microRNA被剪切成21-25个核苷酸成熟的microRNA。
     MicroRNA 自从1993年首次被报道以来,现已经被发现了3000多种,存在于人类和所有的模式生物中。MicroRNA 通过与mRNA的3’ UTR 结合而介导翻译水平的调控,也可通过与mRNA结合的互补程度决定microRNA将以何种机制发生作用;完全的互补引起与RNAi类似的作用,不完全互补则导致翻译抑制作用。因此,研究microRNA对于深入探讨生命现象的本质,解释细胞行为和疾病发生机制,具有重要的理论意义;对于疾病的诊断、治疗和预防具有潜在的实际应用价值。

    关于microRNA:

图1,pre-microRNA 和 microRNA 示意图
 
MicroRNA由于长度太短,一般难以检测。
 
二、BioTNT miRNA qPCR Detection System 介绍
 
BioTNT 生物技术部推出了 miRNA qPCR Detection System , 是专门用于miRNA 定量检测的系统。该系统包括:
·                 miRNA检测试剂盒miRNA qRT-PCR Detection Kit:

      

特点:

 

三、BioTNT QPCR microRNA 样本准备  
 
3.1 组织样本准备
 
  注意:BioTNT QPCR microRNA 检测的样本取样同Real time PCR的组织取样与保存:
1、 取动物的组织,动作要求迅速,尽量避免样本在环境中暴露太久;
2、 讲样本迅速放入无菌无酶的冻存管中,为保证质量,推荐选取Axygen,corning,nunc等国外品牌的冻存管;根据组织块的大小,确定RNA 抽提方式;如果组织块非常小,建议采用柱抽提试剂盒进行抽提( RNeasy Micro Kit(50) 74004 ),此时样本中不要加入trizol;如果组织块有100mg,可以采用trizol 法抽提总RNA的方式(RNA提取试剂盒(Trizol 法) A2010B0A01),进行样本的保存,在样本中加入1ml trizol 浸没样本;
3、 在冻存管上做好标记,尽量清晰易辨;在实验记录本上做好记录,尽量详细易查;
4、 将冻存管直接放入液氮中速冻;或加入1ml Trizol 到冻存管中,再放入液氮速冻;
5、 速冻2h 后,将冻存管从液氮转至-80度冰箱,可以保存6个月左右;
 
BioTNT QPCR microRNA 的细胞取样与保存
1、 悬浮细胞:500g 离心5min 取细胞,用PBS 清洗2-3遍,得细胞,并转至放入冻存管中;
2、 根据细胞量进行后续抽提方式的选择,如果细胞量大于5*10的5次方,可以采用trizol 方式进行总RNA 抽提,如果小于此量,建议采用Qiagen的柱式抽提( RNeasy Micro Kit(50) 74004 
);可以采用trizol 抽提的客户,可在样本中加入500ul Trizol 到冻存管中,吹打混匀(RNA提取试剂盒(Trizol 法) A2010B0A01);
3、 在冻存管上做好标记,尽量清晰易辨;在实验记录本上做好记录,尽量详细易查;
4、 将冻存管放入液氮速冻,2h 后,转至-80度冰箱,可以保存6个月左右;
 
样本运输:干冰运输
 
3.3  血清/血浆样本准备:
建议采用血浆样本,可以得到相对更好的实验结果。
使用抗凝管采集全血,并尽快进行血浆分离:1000g离心10分钟,分离血浆和细胞组分。(注意:血浆收集应使用抗凝管,抗凝剂可以用柠檬酸钠或EDTA等,但一定不要使用肝素抗凝,因为肝素对后续实验有较大影响。)将采集好的血浆转移至单独的冻存管,按照每400-500ul/管分装好。
短期保存,可放入-20℃或-70℃冰箱。长期保存,请放入液氮。
 
3.4  全血样本准备:
请按照实际使用的收集方法,如注射器收集或真空收集管等,参考相应的厂商提供产品说明进行操作。
采集好全血,将采集好的全血转移至单独的冻存管,按照每500ul/管分装好。
短期保存,可放入-20℃或-70℃冰箱。长期保存,请放入液氮。
 
 
3.5  石蜡样本准备:
石蜡切片,至少三片;或者提供石蜡块,常温保存。
 
 
BioTNT QPCR microRNA 检测使用的仪器
 
进行检测使用的主要仪器为QPCR, BioTNT 使用life technology新款的ViiA™ 7实时荧光定量PCR系统进行microRNA的QPCR 检测。
 
ViiA™ 7实时荧光定量PCR系统在单一的高性能仪器上融合了您需要的所有实时荧光定量PCR特性,从而帮助您优化研究效率。ViiA™7系统具有简单的工作流程、直观的软件、触控屏界面以及使误操作降至少的单键实验方案,可提供出众的重复性和小的孔间和仪器间差异。

产率
ViiA™ 7系统适用于中等至高通量实时荧光定量PCR,可提升您的实验室效率。
快速的加热块更换——前开门设计使热循环加热模块的更换变得更容易,无需移动旁边的设备,如机械臂或计算机
简单的触摸屏界面——仪器触摸屏提供了一键式实验方案,可快速简单地完成各种应用Assay的设置
自动化兼容性——ViiA™ 7系统结合了Applied Biosystems® Twister® II 机器人,使您在自动化环境下实现效率大化

整合
可与TaqMan® Array微流体芯片和 Applied Biosystems® TaqMan® Assay完全兼容:实时荧光定量PCR分析的金标准,具有高灵敏度、高特异性和宽动态范围。
384 孔通量且无需机器辅助——采用TaqMan® Array微流体芯片,无需移液机器人或复杂的移液装置;只需加入您的样本和预混液,即可在ViiA™ 7系统上运行
与全套 TaqMan® Assay 兼容——ViiA™ 7系统已经过优化,可用于所有TaqMan® Assay(包括 MicroRNA、蛋白质、非编码 RNA 和Pri-miRNA Assay),从而获得清晰简洁的数据

性能
ViiA™ 7系统具有下列特点:
OptiFlex® 系统——增强型荧光检测,可实现准确且灵敏的数据分析
大程度的多重分析能力——6 个可自由组合的激发和发射滤光片通道,可实现多的染料组合和大的多重反应能力
灵活的数据采集——多种升降温方法检测形式为升降温阶段的荧光数据采集提供了更多的灵活性
精确定量——在单色反应中可检测出低至1.5倍的拷贝数差异

ViiA™ 7软件具有:
直观的界面和创新的设计
便捷的自动化操作
更强大的数据分析
与高通量完全兼容

可扩展的软件构架
提供可选的附加性能,可升级至现有软件。
遵循美国联邦法规第21章第11节(21 CFR Part 11)——可选的SAE模块,提供记录安全、审计和电子签名信息,从而实现全方位的数据可追溯性
高分辨率熔解曲线(HRM)——采用内置的MeltDoctor™ 实验方案和校准,您可以缩短优化运行的时间,从而将更多的时间用于分析您的结果。通过方便的软件设置即可根据需要设置基因型种类的数目。

 

仪器图片:

 
 
 
五、BioTNT QPCR microRNA 检测标准服务流程
 
BioTNT  microRNA 检测技术服务标准流程:
1、 客户提供样本(组织,细胞或者RNA),请参照取样与保存;
2、 客户提供检测指标;
3、与客户协商内参的选取(人,大鼠,小鼠均有两种内参可以采用);
4、采用 BioTNT  PCRmiRNA qPCR Detection System ;
5、客户样本验证进行抽提,特异性逆转录,QPCR 检测,验证系统是否好用;
6、 客户的大批量样本进行处理,抽提和实验。
 
实验对象为组织样品,组织量不是很少的情况下,可以采用trizol 法进行抽提。取适量(50-100mg)新鲜组织样品或正确保存的组织样品加1ml的RNA抽提试剂Trizol(Invitrogen),匀浆后抽提RNA。
实验对象为细胞样品,细胞数量不是很少的情况下,可以采用trizol 法进行抽提。每份样品取1×106~1×107细胞,PBS清洗细胞,去PBS加1ml的RNA抽提试剂Trizol(Invitrogen),裂解后抽提RNA。
 
组织块少或者细胞量小的时候,采用Qiagen 柱式抽提(RNeasy Micro Kit(50) 74004 )。费用为120元/个;
 
血液样本,如血浆或者血清,采用Qiagen miRNeasy Serum/Plasma Kit(50)217184 ,费用为140元/个;
石蜡样本,采用miRNeasy FFPE kit(50)217504,费用为160元/个;
 
7、 RNA 特异性逆转录得到内参CDNA, 对样本的质量进行验证;
8、 大批量样本real time PCR实验;使用仪器为:ABI 公司的Vii7;
9、 靶基因表达水平结果分析,数据分析方法为:delta delta CT 法;也可以采用相对定量的标准曲线法;
10、 提供客户实验报告;包括方法,材料,设备,原始数据和计算数据的成套材料;
 
 
六、BioTNT real time PCR 检测技术服务收费标准

实验步骤
 
组织或细胞总RNA抽提   80元(trizol抽提microRNA,一个组织或细胞标本);
离心柱式抽提费用细胞/组织 120元/样;
血清/血浆 140元/样;
石蜡切片 160元/样

 特异性逆转录+目的基因实时定量PCR    数据分析   双重复数据120元(一个标本一个指标),三重复数据160元 (内参同样按照目的基因收费)

引物等费用涵盖在这里面;

 如需制备标准曲线,收取标准曲线制备费用200元/一个基因

 一次取样,超过3个,免费;小于等于3个样品, 上海市区收取20元/次的取样费用;上海郊区,不上门取样;

外地邮寄费用自理;

全套技术服务
您只需提供组织或细胞标本,我们为您完成RNA抽提,cDNA制备,实时定量PCR,标准曲线制备及数据分析的所有步骤。
 

【您只需提供】

组织
或,高浓度的Total RNA
◇microRNA 名称
 
【我们向您提供】 
实验材料、仪器、方法、步骤
供发表的引物序列、扩增曲线、熔解曲线
原始实验数据和计算好的正式实验数据
免费实验培训、技术支持