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BioTNT PCR ARRAY of Human Skeletal Muscle: Myoge…
    产品中心    >>  试剂    >>  分子生物学试剂    >>  PCR Array 关   闭
PCR ARRAY of Human Skeletal Muscle: Myogenesis & Myopathy+ primer
分类:PCR Array
品牌:BioTNT
货号:A2020A0145H/B
原价:7200
现价:¥5538.00    节省:¥1662
特异性种属:human
规格:250板
产品参数

一、产品介绍:


PCR Array

 

 

BioTNT qPCR Array专为检测不同组织或细胞中特定基因的表达量而设计,这些基因按照预制或定制要求成套设置。检测结果所显示的表达差异可帮助研究者鉴定或验证这些基因的生物学意义,以及与其研究的重要相关性。

对于目录(预制)产品,每块384孔板包含84对PCR引物,可以进行4个样本单孔或者两个样本双复的实验。这些引物全部经过预先验证,并包被于指定的板孔中。在同一块96孔板上,有12个(384孔板有48个)反应孔包被了不同类型的对照,用以检测从反转录到qPCR整个过程的反应效率。

逆转录试剂和以荧光染料SYBR?Green 为基础的定量检测试剂作为被推荐的RT-qPCR试剂产品可与qPCR Array配套使用。该系列试剂均经过优化,具有高的灵敏度、效率和特异性。其他公司的类似试剂可能适用,但未验证过,不推荐使用。

 

产品优势


BioTNT QPCR芯片特点:

灵敏度高,样本使用量低

线性范围广,可同时检测表达水平差异大的基因

每个基因的检测引物优化后保证高扩增率和产物单一

重复性高,Ct值的平均差异只有0.25个循环

覆盖范围广:目录产品包含通路分析、疾病研究;

定制产品可根据客户要求选择设置 
数据分析方便:专用软件方便数据统计与分析

 


产品说明


The Human Skeletal Muscle Development & Disease RT2 Profiler? PCR Array profiles the expression of 84 key genes involved in skeletal muscle differentiation, function and disease-related processes. Skeletal muscle’s role in voluntary movement contributes greatly to energy metabolism and its regulation via glucose uptake and storage by insulin. Complications from aging and metabolic diseases like diabetes and metabolic syndrome contribute to muscle wasting (atrophy). However, recent research hypothesizes that metabolic defects in skeletal muscle contribute to the etiology of diabetes and metabolic syndrome, suggesting that skeletal muscle has a larger role in these disease states than initially expected. Large heterogeneous protein complexes including titin or dystrophin facilitate muscle contraction by connecting the skeletal muscle cytoskeleton to the extracellular matrix. Muscular dystrophies arise from inherited mutations in the genes encoding components of these complexes, and gene expression changes disrupting their normal contractile function dysregulate signaling pathways that control muscle growth. Potential therapies for muscle wasting include generation of new muscle cells (myogenesis) or increasing the mass of current muscle cells (hypertrophy). Thus, muscle-specific biological and pathophysiological processes are interrelated and cannot be studied in isolation. This array includes genes important for basic skeletal muscle function, development and growth, as well as genes related to the disease processes of metabolic syndrome and muscle wasting. Using real-time PCR, you can easily and reliably analyze the expression of a focused panel of genes involved in skeletal muscle development and disease with this array.

 

 

 

二.运输和储存条件:


4度运输。

-20°C储存至少6个月;

 

 

三.适用仪器:


lifetechnoliges(原ABI) 7900, Viaa 7 等可使用384微孔板的QPCR 仪器。

也可以定制其他机器形式:

Biotnt 可提供多种与以下qPCR仪器匹配的qPCR array类型。

重要提示:在订购前,请根据您的qPCR仪器型号选购合适的array类型;在收到产品后,请及时确认收到的array是否与您的qPCR仪器匹配。如果您的仪器类型不在下表所列类型中,请及时联系本公司技术支持咨询。

 

plate format

Instrument provider

QPCR instrument model

A(384well)

lifetechnologies

7900,ViiA7(384 well block)

B(96 well)

lifetechnologies

7300,7500,7700,7900(standard 96well),ViiA7(standard 96well)

C(96 well)

lifetechnologies

7500(fast block),7900HT(fast block),stepone plus,ViiA 7(Fast block)

D(96 well)

Biorad

iCycler,MyiQ, iQ5

E(96 well)

Biorad

CFX96,DNA Engine opticon,opticon 2,Chromo4

 

四.质量标准(QC


1. biotnt gene qPCR array中检测的基因引物,经实验验证结果分析,融解曲线均呈单一锐锋,电泳条带均呈单一条带,说明这些引物均是特异扩增引物,验证合格。

2. PTC(阳性对照)反应孔,从融解曲线上分析均呈单一锐锋,从扩增曲线上分析,CT值介于18~22之间。

3. RTC(spike-in反转录对照)反应孔,从融解曲线上分析均呈单一锐锋,从扩增曲线上分析,CT值介于17~23之间。

4. HGDC 的CT 值应大于35,说明样本中没有基因组污染。

5. RTC和 PTC的三重复CT 值应比较接近,说明实验重复性好。

6. 板与板之间(批内)重复性达0.99以上,具有高度重复性。

 

 

五.基因(引物)排布 :

每一个样本区里的基因排列如下:

 

 

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

基因1

基因2

基因3

基因4

基因5

基因6

基因7

基因8

基因9

基因10

基因11

基因12

B

基因13

基因14

基因15

基因16

基因17

基因18

基因19

基因20

基因21

基因22

基因23

基因24

C

基因25

基因26

基因27

基因28

基因29

基因30

基因31

基因32

基因33

基因34

基因35

基因36

D

基因37

基因38

基因39

基因40

基因41

基因42

基因43

基因44

基因45

基因46

基因47

基因48

E

基因49

基因50

基因51

基因52

基因53

基因54

基因55

基因56

基因57

基因58

基因59

基因60

F

基因61

基因62

基因63

基因64

基因65

基因66

基因67

基因68

基因69

基因70

基因71

基因72

G

基因73

基因74

基因75

基因76

基因77

基因78

基因79

基因80

基因81

基因82

基因83

基因84

H

HK1

HK2

HK3

GDC

GDC

GDC

RTC

RTC

RTC

PTC

PTC

PTC

 

& 基因引物:84个反应孔(从A排到G排)已预先交联好特异基因引物(详见基因引物列表)。

HK1-3:3条已交联的管家基因(内参)引物,可作为array数据标准化过程中样品的阳性对照。

&GDC:基因组DNA对照,可用于qPCR反应体系中是否有基因组DNA污染。

RTC:spike-in反转录对照,可用于检测RT反应的效率。这些已交联的引物可特异性扩增样品中外源性spike-in RNA反转录形成的cDNA模板。

PTC:阳性PCR对照,已交联DNA阳性质粒模板,主要用于实时监测array反应板的PCR扩增效率。

 

 

基因信息列表


  Symbol GeneBank
基因1 ACTA1 NM_001100
基因2 ACTN3 NM_001104
基因3 ACVR2B NM_001106
基因4 ADIPOQ NM_004797
基因5 ADRB2 NM_000024
基因6 AGRN NM_198576
基因7 AKT1 NM_005163
基因8 AKT2 NM_001626
基因9 ATP2A1 NM_173201
基因10 BCL2 NM_000633
基因11 BMP4 NM_130851
基因12 CAMK2G NM_001222
基因13 CAPN2 NM_001748
基因14 CAPN3 NM_173090
基因15 CASP3 NM_004346
基因16 CAST NM_001042440
基因17 CAV1 NM_001753
基因18 CAV3 NM_001234
基因19 CRYAB NM_001885
基因20 CS NM_004077
基因21 CTNNB1 NM_001904
基因22 DAG1 NM_004393
基因23 DES NM_001927
基因24 DMD NM_000109
基因25 DMPK NM_004409
基因26 DYSF NM_003494
基因27 FBXO32 NM_058229
基因28 FGF2 NM_002006
基因29 FOXO1 NM_002015
基因30 FOXO3 NM_001455
基因31 HDAC5 NM_005474
基因32 HK2 NM_000189
基因33 IGF1 NM_000618
基因34 IGF2 NM_000612
基因35 IGFBP3 NM_000598
基因36 IGFBP5 NM_000599
基因37 IKBKB NM_001556
基因38 IL1B NM_000576
基因39 IL6 NM_000600
基因40 LEP NM_000230
基因41 LMNA NM_005572
基因42 MAPK1 NM_002745
基因43 MAPK14 NM_001315
基因44 MAPK3 NM_002746
基因45 MAPK8 NM_002750
基因46 MB NM_005368
基因47 MEF2C NM_002397
基因48 MMP9 NM_004994
基因49 MSTN NM_005259
基因50 MUSK NM_005592
基因51 MYF5 NM_005593
基因52 MYF6 NM_002469
基因53 MYH1 NM_005963
基因54 MYH2 NM_017534
基因55 MYOD1 NM_002478
基因56 MYOG NM_002479
基因57 MYOT NM_006790
基因58 NEB NM_004543
基因59 NFKB1 NM_003998
基因60 NOS2 NM_000625
基因61 PAX3 NM_181461
基因62 PAX7 NM_002584
基因63 PDK4 NM_002612
基因64 PPARG NM_015869
基因65 PPARGC1A NM_013261
基因66 PPARGC1B NM_133263
基因67 PPP3CA NM_000944
基因68 PRKAA1 NM_006251
基因69 PRKAB2 NM_005399
基因70 PRKAG1 NM_002733
基因71 PRKAG3 NM_017431
基因72 RHOA NM_001664
基因73 RPS6KB1 NM_003161
基因74 SGCA NM_000023
基因75 SLC2A4 NM_001042
基因76 TGFB1 NM_000660
基因77 TNF NM_000594
基因78 TNNC1 NM_003280
基因79 TNNI2 NM_003282
基因80 TNNT1 NM_003283
基因81 TNNT3 NM_006757
基因82 TRIM63 NM_032588
基因83 TTN NM_003319
基因84 UTRN NM_007124

1.     任何一台能够做QPCR的仪器据能够做PCRarray吗?

回答:基本上任意一台的QPCR 仪器都可以进行QPCR array的实验。

BioTNT根据仪器采用的96孔或者384孔板,分为以下5种板型(plate format

plate format

Instrument provider

QPCR instrument model

A(384well)

lifetechnologies

7900ViiA7(384 well block)

B(96 well)

lifetechnologies

7300,7500,7700,7900standard 96well),ViiA7standard 96well

C(96 well)

lifetechnologies

7500(fast block)7900HTfast block),stepone plusViiA 7(Fast block)

D(96 well)

Biorad

iCyclerMyiQ, iQ5

E(96 well)

Biorad

CFX96DNA Engine opticonopticon 2Chromo4

请您在订购时提供您使用的QPCR 仪器,我们也可以为您确定plate format;如果您的仪器不在以上清单上,也可以邮件咨询我们,我们会有专业的技术人员为您确定相应的plate format

 

2. BioTNT PCR array的适用在哪里?

回答:适用现有的通路研究;

适用少样本或中等样本,多基因的QPCR 检测;

在低样本或中等样本的情况下,费用和时间远小于自行建立QPCR实验;

使用方便,操作简单,结果稳定性好;

 

3. BioTNT PCR array的优点是什么?

回答:灵敏度高,样本使用量低;

线性范围广,可同时检测表达水平差异大的基因;

每个基因的检测引物优化后保证高扩增率和产物单一;

重复性高,Ct值的平均差异只有0.25个循环;

覆盖范围广:目录产品包含通路分析、疾病研究;

定制产品可根据客户要求选择设置 
数据分析方便:专用软件方便数据统计与分析

 

4. QPCR 得到实验数据后,如何进行后续的结果分析?需要配套的仪器设备吗?

回答: 您可以用这个链接,http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx

点击分析工具,然后再点击:分析软件下载下载后进行分析。不需要特殊的分析仪器。

 

5.   BioTNT PCR array,如果自己使用,需要购买哪些配套产品?

回答:您可以用这个链接,http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx

点击相关产品;

建议除了您要使用的PCR array 产品之外,您应购买以下产品,对PCR array进行配套使用:

PCR array cDNA第一链合成试剂盒 A2010B0B03  
Real time 染料PCR PreMIX A2010A0112
建议使用高品质的抽提试剂盒,推荐型号为:

Qiagen RNeasy Mini Kit (50) 74104
RNase-Free DNase Set (50)79254 

 

6. 如果使用其他公司的抽提试剂盒,如Trizol 法抽提试剂盒,能否使用BioTNTPCR array产品?

回答:建议抽提时尽量使用高质量的样本,高质量的抽提试剂盒,并在抽提时进行DNA 去除;使用PCR array 产品前,先进行样本质量的验证。能够通过样本质量验证的样本,可以进行PCR array实验。

 

7. 如何进行PCR array 实验前的样本质量验证?

回答:为了保证PCR array实验的质量,建议在使用前先进行样本质量验证;

RNA 定量与质量控制

A.  使用无菌水(RNase-free)稀释 RNA 样本,检测 260  nm  280  nm 吸光值,A260/280 应大于 1.8

B.  使用公式A260× 40 ×稀释倍数  = XXXXμg/mL 计算 RNA 浓度。

C.  使用琼脂糖凝胶电泳检测 RNA 完整性。

D.  建议:RNA 质量测定后,逆转录得到CDNA,建议用多个内参基因自行验证CDNA 质量;

推荐购买biotnt 的样本质量验证引物套装,可以在进行QPCR 之前对样本进行验证(包含内参引物,如human beta actin GAPDH,  18sRNA)

E.  基因组DNA污染控制

每个Array板块上的GDC(Genomic  DNA  Control)反应孔专为检测每个样品进行qPCR反应时可能存在的基因组DNA污染而设置。如果该反应孔的CT值小于35,则表明存在可检测到的基因组DNA污染,应采取措施予以解决。因此,必须从RNA样品中去除基因组和其他全部残余污染物。建议采用Qiagen 柱式抽提过程中加入DNAse去除基因组污染。

建议在进行PCR array 之前购买BioTNT 样本质量验证引物套装或者单独的GDC 引物进行基因组DNA 污染控制的质量验证;验证结果CT 值如果小于35,则表明存在可检测到的基因组DNA污染,应采取措施予以解决。

 

8. 如何进行样本的调平?

回答:进行PCR array之前,对样本需要进行调平。具体调平方式为:  

1.     RNA 含量调平:实验样本的RNA 尽量调到同一水平;加入RNA free的水,调整RNA浓度;

2.   调平后的样本:通过内参引物进行验证,根据CT 值,进行二次调平。

 

9. BioTNT PCR array定制费用如何?

回答:目前BioTNT PCR array 提供您的定制,仅比预制产品增加了400/板的定制费用。您可以把您要检测的指标给我们,然后把您的仪器型号,以及sample 数量,重复数量提供给我们,我们为您设置相应的PCR array 形式,并核算相应的费用给您。

BioTNT PCR array的定制,方式灵活,1 plate起订。

详细请参考:http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx,点击定制服务

 

10.        如果我没有QPCR 仪器,BioTNT 能够提供什么服务?

回答:您可以选择BioTNT PCR array service

     详细请参考:http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx,点击service

 

 

 

产品咨询:sales@biotnt.com    BioTNT订阅号:
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2. 由于某些产品的英文名较多,可更换关键词搜索;
3. 当进行品名搜索时,切勿将品名和种类同时输入,否则就有可能搜索不到产品(例如:FAST Frame for Chip Kits - 4 Slide frame 生物芯片,将有可能搜索不到产品或者过多的产品);
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