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BioTNT PCR ARRAY of Rat Mitochondria+ primer
    产品中心    >>  试剂    >>  分子生物学试剂    >>  PCR Array 关   闭
PCR ARRAY of Rat Mitochondria+ primer
分类:PCR Array
品牌:BioTNT
货号:A2020A0103R/B
原价:7200
现价:¥5538.00    节省:¥1662
特异性种属:rat
规格:250板
产品参数

一、产品介绍:


PCR Array

 

 

BioTNT qPCR Array专为检测不同组织或细胞中特定基因的表达量而设计,这些基因按照预制或定制要求成套设置。检测结果所显示的表达差异可帮助研究者鉴定或验证这些基因的生物学意义,以及与其研究的重要相关性。

对于目录(预制)产品,每块384孔板包含84对PCR引物,可以进行4个样本单孔或者两个样本双复的实验。这些引物全部经过预先验证,并包被于指定的板孔中。在同一块96孔板上,有12个(384孔板有48个)反应孔包被了不同类型的对照,用以检测从反转录到qPCR整个过程的反应效率。

逆转录试剂和以荧光染料SYBR?Green 为基础的定量检测试剂作为被推荐的RT-qPCR试剂产品可与qPCR Array配套使用。该系列试剂均经过优化,具有高的灵敏度、效率和特异性。其他公司的类似试剂可能适用,但未验证过,不推荐使用。

 

产品优势


BioTNT QPCR芯片特点:

灵敏度高,样本使用量低

线性范围广,可同时检测表达水平差异大的基因

每个基因的检测引物优化后保证高扩增率和产物单一

重复性高,Ct值的平均差异只有0.25个循环

覆盖范围广:目录产品包含通路分析、疾病研究;

定制产品可根据客户要求选择设置 
数据分析方便:专用软件方便数据统计与分析

 

产品说明

   

The Rat Mitochondria   PCR Array profiles the expression of 84 genes involved in the biogenesis and function of the cell's powerhouse organelle. The genes monitored by this array include regulators and mediators of mitochondrial molecular transport of not only the metabolites needed for the electron transport chain and oxidative phosphorylation, but also the ions required for maintaining the mitochondrial membrane polarization and potential important for ATP synthesis. Metabolism and energy production are not the only functions of mitochondria. Intrinsic apoptosis pathway genes activated by intracellular damage signaling are also represented on this array. Despite the mitochondrion's origins and its chromosome, the cellular genomic DNA encodes most of the proteins essential for mitochondrial replication and function. Therefore, this array's genes also target and translocate previously translated and folded proteins across and/or into the outer and/or inner mitochondrial membranes and even into the mitochondrial matrix. Using real-time PCR, you can easily and reliably analyze the expression of a focused panel of genes involved in the diverse cellular functions of mitochondrial biology with this array.

 

 

二.运输和储存条件:


4度运输。

-20°C储存至少6个月;

 

 

三.适用仪器:


lifetechnoliges(原ABI) 7900, Viaa 7 等可使用384微孔板的QPCR 仪器。

也可以定制其他机器形式:

Biotnt 可提供多种与以下qPCR仪器匹配的qPCR array类型。

重要提示:在订购前,请根据您的qPCR仪器型号选购合适的array类型;在收到产品后,请及时确认收到的array是否与您的qPCR仪器匹配。如果您的仪器类型不在下表所列类型中,请及时联系本公司技术支持咨询。

 

plate format

Instrument provider

QPCR instrument model

A(384well)

lifetechnologies

7900,ViiA7(384 well block)

B(96 well)

lifetechnologies

7300,7500,7700,7900(standard 96well),ViiA7(standard 96well)

C(96 well)

lifetechnologies

7500(fast block),7900HT(fast block),stepone plus,ViiA 7(Fast block)

D(96 well)

Biorad

iCycler,MyiQ, iQ5

E(96 well)

Biorad

CFX96,DNA Engine opticon,opticon 2,Chromo4

 

四.质量标准(QC


1. biotnt gene qPCR array中检测的基因引物,经实验验证结果分析,融解曲线均呈单一锐锋,电泳条带均呈单一条带,说明这些引物均是特异扩增引物,验证合格。

2. PTC(阳性对照)反应孔,从融解曲线上分析均呈单一锐锋,从扩增曲线上分析,CT值介于18~22之间。

3. RTC(spike-in反转录对照)反应孔,从融解曲线上分析均呈单一锐锋,从扩增曲线上分析,CT值介于17~23之间。

4. HGDC 的CT 值应大于35,说明样本中没有基因组污染。

5. RTC和 PTC的三重复CT 值应比较接近,说明实验重复性好。

6. 板与板之间(批内)重复性达0.99以上,具有高度重复性。

 

 

五.基因(引物)排布 :

每一个样本区里的基因排列如下:

 

 

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

基因1

基因2

基因3

基因4

基因5

基因6

基因7

基因8

基因9

基因10

基因11

基因12

B

基因13

基因14

基因15

基因16

基因17

基因18

基因19

基因20

基因21

基因22

基因23

基因24

C

基因25

基因26

基因27

基因28

基因29

基因30

基因31

基因32

基因33

基因34

基因35

基因36

D

基因37

基因38

基因39

基因40

基因41

基因42

基因43

基因44

基因45

基因46

基因47

基因48

E

基因49

基因50

基因51

基因52

基因53

基因54

基因55

基因56

基因57

基因58

基因59

基因60

F

基因61

基因62

基因63

基因64

基因65

基因66

基因67

基因68

基因69

基因70

基因71

基因72

G

基因73

基因74

基因75

基因76

基因77

基因78

基因79

基因80

基因81

基因82

基因83

基因84

H

HK1

HK2

HK3

GDC

GDC

GDC

RTC

RTC

RTC

PTC

PTC

PTC

 

& 基因引物:84个反应孔(从A排到G排)已预先交联好特异基因引物(详见基因引物列表)。

HK1-3:3条已交联的管家基因(内参)引物,可作为array数据标准化过程中样品的阳性对照。

&GDC:基因组DNA对照,可用于qPCR反应体系中是否有基因组DNA污染。

RTC:spike-in反转录对照,可用于检测RT反应的效率。这些已交联的引物可特异性扩增样品中外源性spike-in RNA反转录形成的cDNA模板。

PTC:阳性PCR对照,已交联DNA阳性质粒模板,主要用于实时监测array反应板的PCR扩增效率。

 

 

基因引物列表

 

  Symbol GeneBank
基因1  Aifm2  NM_001139483
基因2  Aip  NM_172327
基因3  Akt1  NM_033230
基因4  Bak1  NM_053812
基因5  Bbc3  NM_173837
基因6  Bcl2  NM_016993
基因7  Bcl2l1  NM_031535
基因8  Bid  NM_022684
基因9  Bnip3  NM_053420
基因10  Cav2  NM_131914
基因11  Cdkn2a  NM_031550
基因12  Cln8  NM_001007686
基因13  Cox18  NM_001106000
基因14  Cpt1b  NM_013200
基因15  Cpt2  NM_012930
基因16  Dnm1l  NM_053655
基因17  Fis1  NM_001105919
基因18  Timm10b  NM_053371
基因19  Gclc  NM_012815
基因20  Gclm  NM_017305
基因21  Gpx1  NM_030826
基因22  Grpel1  NM_024487
基因23  Hsp90aa1  NM_175761
基因24  Hspd1  NM_022229
基因25  Immp1l  XM_001076990
基因26  LOC691853  XM_003752336
基因27  Mfn1  NM_138976
基因28  Mfn2  NM_130894
基因29  Mipep  NM_031052
基因30  Msto1  NM_001106443
基因31  Mtx2  NM_001008286
基因32  Nefl  NM_031783
基因33  Opa1  NM_133585
基因34  Pmaip1  NM_001008385
基因35  Ppargc1a  NM_031347
基因36  Rhot2  NM_181823
基因37  Rnf135  NM_001012010
基因38  Sfn  XM_001065560
基因39  Sh3glb1  NM_001011929
基因40  Slc25a10  NM_133418
基因41  Slc25a12  XM_006224624
基因42  Slc25a13  XM_342640
基因43  Slc25a14  NM_053501
基因44  Slc25a15  NM_001047880
基因45  Slc25a16  NM_001100860
基因46  Slc25a17  NM_001126269
基因47  Slc25a19  NM_001007674
基因48  Slc25a2  NM_001106152
基因49  Slc25a20  NM_053965
基因50  Slc25a21  NM_133614
基因51  Slc25a22  NM_001014027
基因52  Slc25a23  NM_001106873
基因53  Slc25a24  NM_001127544
基因54  Slc25a25  NM_145677
基因55  Slc25a27  NM_053500
基因56  Slc25a3  NM_139100
基因57  Slc25a30  NM_001013187
基因58  Slc25a36  XM_576451
基因59  Slc25a37  NM_001013996
基因60  Slc25a4  NM_053515
基因61  Slc25a5  NM_057102
基因62  Sod1  NM_017050
基因63  Sod2  NM_017051
基因64  Stard3  NM_001014229
基因65  Taz  NM_001025748
基因66  Timm10  NM_172074
基因67  Timm17a  NM_019351
基因68  Timm17b  NM_001108249
基因69  Timm22  NM_032618
基因70  Timm44  NM_017267
基因71  Timm8a1  NM_053370
基因72  Timm8b  NM_022541
基因73  Timm9  NM_001276429
基因74  Tomm22  NM_212514
基因75  Tomm34  NM_001044244
基因76  Tomm40  NM_212520
基因77  Tomm40l  NM_001083338
基因78  Tomm70a  NM_212519
基因79  Tp53  NM_030989
基因80  Tspo  NM_012515
基因81  Ucp1  NM_012682
基因82  Ucp2  NM_019354
基因83  Ucp3  NM_013167
基因84  Uxt  NM_001006982

1.     任何一台能够做QPCR的仪器据能够做PCRarray吗?

回答:基本上任意一台的QPCR 仪器都可以进行QPCR array的实验。

BioTNT根据仪器采用的96孔或者384孔板,分为以下5种板型(plate format

plate format

Instrument provider

QPCR instrument model

A(384well)

lifetechnologies

7900ViiA7(384 well block)

B(96 well)

lifetechnologies

7300,7500,7700,7900standard 96well),ViiA7standard 96well

C(96 well)

lifetechnologies

7500(fast block)7900HTfast block),stepone plusViiA 7(Fast block)

D(96 well)

Biorad

iCyclerMyiQ, iQ5

E(96 well)

Biorad

CFX96DNA Engine opticonopticon 2Chromo4

请您在订购时提供您使用的QPCR 仪器,我们也可以为您确定plate format;如果您的仪器不在以上清单上,也可以邮件咨询我们,我们会有专业的技术人员为您确定相应的plate format

 

2. BioTNT PCR array的适用在哪里?

回答:适用现有的通路研究;

适用少样本或中等样本,多基因的QPCR 检测;

在低样本或中等样本的情况下,费用和时间远小于自行建立QPCR实验;

使用方便,操作简单,结果稳定性好;

 

3. BioTNT PCR array的优点是什么?

回答:灵敏度高,样本使用量低;

线性范围广,可同时检测表达水平差异大的基因;

每个基因的检测引物优化后保证高扩增率和产物单一;

重复性高,Ct值的平均差异只有0.25个循环;

覆盖范围广:目录产品包含通路分析、疾病研究;

定制产品可根据客户要求选择设置 
数据分析方便:专用软件方便数据统计与分析

 

4. QPCR 得到实验数据后,如何进行后续的结果分析?需要配套的仪器设备吗?

回答: 您可以用这个链接,http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx

点击分析工具,然后再点击:分析软件下载下载后进行分析。不需要特殊的分析仪器。

 

5.   BioTNT PCR array,如果自己使用,需要购买哪些配套产品?

回答:您可以用这个链接,http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx

点击相关产品;

建议除了您要使用的PCR array 产品之外,您应购买以下产品,对PCR array进行配套使用:

PCR array cDNA第一链合成试剂盒 A2010B0B03  
Real time 染料PCR PreMIX A2010A0112
建议使用高品质的抽提试剂盒,推荐型号为:

Qiagen RNeasy Mini Kit (50) 74104
RNase-Free DNase Set (50)79254 

 

6. 如果使用其他公司的抽提试剂盒,如Trizol 法抽提试剂盒,能否使用BioTNTPCR array产品?

回答:建议抽提时尽量使用高质量的样本,高质量的抽提试剂盒,并在抽提时进行DNA 去除;使用PCR array 产品前,先进行样本质量的验证。能够通过样本质量验证的样本,可以进行PCR array实验。

 

7. 如何进行PCR array 实验前的样本质量验证?

回答:为了保证PCR array实验的质量,建议在使用前先进行样本质量验证;

RNA 定量与质量控制

A.  使用无菌水(RNase-free)稀释 RNA 样本,检测 260  nm  280  nm 吸光值,A260/280 应大于 1.8

B.  使用公式A260× 40 ×稀释倍数  = XXXXμg/mL 计算 RNA 浓度。

C.  使用琼脂糖凝胶电泳检测 RNA 完整性。

D.  建议:RNA 质量测定后,逆转录得到CDNA,建议用多个内参基因自行验证CDNA 质量;

推荐购买biotnt 的样本质量验证引物套装,可以在进行QPCR 之前对样本进行验证(包含内参引物,如human beta actin GAPDH,  18sRNA)

E.  基因组DNA污染控制

每个Array板块上的GDC(Genomic  DNA  Control)反应孔专为检测每个样品进行qPCR反应时可能存在的基因组DNA污染而设置。如果该反应孔的CT值小于35,则表明存在可检测到的基因组DNA污染,应采取措施予以解决。因此,必须从RNA样品中去除基因组和其他全部残余污染物。建议采用Qiagen 柱式抽提过程中加入DNAse去除基因组污染。

建议在进行PCR array 之前购买BioTNT 样本质量验证引物套装或者单独的GDC 引物进行基因组DNA 污染控制的质量验证;验证结果CT 值如果小于35,则表明存在可检测到的基因组DNA污染,应采取措施予以解决。

 

8. 如何进行样本的调平?

回答:进行PCR array之前,对样本需要进行调平。具体调平方式为:  

1.     RNA 含量调平:实验样本的RNA 尽量调到同一水平;加入RNA free的水,调整RNA浓度;

2.   调平后的样本:通过内参引物进行验证,根据CT 值,进行二次调平。

 

9. BioTNT PCR array定制费用如何?

回答:目前BioTNT PCR array 提供您的定制,仅比预制产品增加了400/板的定制费用。您可以把您要检测的指标给我们,然后把您的仪器型号,以及sample 数量,重复数量提供给我们,我们为您设置相应的PCR array 形式,并核算相应的费用给您。

BioTNT PCR array的定制,方式灵活,1 plate起订。

详细请参考:http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx,点击定制服务

 

10.        如果我没有QPCR 仪器,BioTNT 能够提供什么服务?

回答:您可以选择BioTNT PCR array service

     详细请参考:http://www.biotnt.com/product/PCR-Array.aspx,点击service

 

 

 

 

产品咨询:sales@biotnt.com    BioTNT订阅号:
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