产品参数
一、产品介绍：
BioTNT qPCR Array专为检测不同组织或细胞中特定基因的表达量而设计，这些基因按照预制或定制要求成套设置。检测结果所显示的表达差异可帮助研究者鉴定或验证这些基因的生物学意义，以及与其研究的重要相关性。
对于目录(预制)产品，每块384孔板包含84对PCR引物，可以进行4个样本单孔或者两个样本双复的实验。这些引物全部经过预先验证，并包被于指定的板孔中。在同一块96孔板上，有12个(384孔板有48个)反应孔包被了不同类型的对照，用以检测从反转录到qPCR整个过程的反应效率。
逆转录试剂和以荧光染料SYBR?Green 为基础的定量检测试剂作为被推荐的RT-qPCR试剂产品可与qPCR Array配套使用。该系列试剂均经过优化，具有高的灵敏度、效率和特异性。其他公司的类似试剂可能适用，但未验证过，不推荐使用。
产品优势
BioTNT QPCR芯片特点：
灵敏度高，样本使用量低
线性范围广，可同时检测表达水平差异大的基因
每个基因的检测引物优化后保证高扩增率和产物单一
重复性高，Ct值的平均差异只有0.25个循环
覆盖范围广：目录产品包含通路分析、疾病研究；
定制产品可根据客户要求选择设置
数据分析方便：专用软件方便数据统计与分析
产品说明
PCR Array introduction：The Rat AMPK Signaling RT2 Profiler PCR Array profiles the expression of 84 key genes involved in signal transduction by the AMP-activated protein kinase complex (AMPK). AMPK is a heterotrimeric complex composed of a catalytic alpha subunit and regulatory beta and gamma subunits. AMP binds the regulatory gamma subunit to allosterically open the alpha subunit for phosphorylation and activation by LKB1 (STK11) or calcium/calmodulin-dependent protein kinases (CAMKK). Cellular stresses that inhibit ATP production (such as low glucose, hypoxia, ischemia, and heat shock), hormone signaling (via AKT and PI3 kinase), and cAMP-dependent protein kinase all activate AMPK complex. AMPK activity then stimulates ATP synthetic processes (such as fatty acid oxidation and autophagy) and suppresses ATP consumptive processes (such as gluconeogenesis, lipid synthesis, and protein synthesis). AMPK signaling exerts its control at both the post-translational and transcriptional levels by phosphorylating either the proteins directly involved in these processes or the transcription factors regulating their expression, respectively. Its role in controlling both glucose and lipid metabolism makes AMPK a potential therapeutic target for treating type II diabetes mellitus, obesity, and cancer. AMPK also plays critical roles in models of aging by modulating mTOR signaling. Analyzing the expression of AMPK signaling genes can help to clarify its role in these normal and pathophysiological processes at the molecular level. The genes on this array encode the components of the kinase complex itself, its upstream regulators, and its targets in several key biological processes. A set of controls present on each array enables data analysis using the ΔΔCT method of relative quantification and assessment of reverse transcription performance, genomic DNA contamination, and PCR performance. Using real-time PCR, research studies can easily and reliably analyze the expression of a focused panel of genes responsive to AMPK signaling with this array.
二．运输和储存条件：
4度运输。
-20°C储存至少6个月；
三．适用仪器：
lifetechnoliges（原ABI） 7900， Viaa 7 等可使用384微孔板的QPCR 仪器。
也可以定制其他机器形式：
Biotnt 可提供多种与以下qPCR仪器匹配的qPCR array类型。
重要提示：在订购前，请根据您的qPCR仪器型号选购合适的array类型；在收到产品后，请及时确认收到的array是否与您的qPCR仪器匹配。如果您的仪器类型不在下表所列类型中，请及时联系本公司技术支持咨询。
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plate format
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Instrument provider
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QPCR instrument model
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A(384well)
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lifetechnologies
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7900，ViiA7(384 well block)
|
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B(96 well)
|
lifetechnologies
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7300,7500,7700,7900（standard 96well），ViiA7（standard 96well）
|
|
C(96 well)
|
lifetechnologies
|
7500(fast block)，7900HT（fast block），stepone plus，ViiA 7(Fast block)
|
|
D(96 well)
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Biorad
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iCycler，MyiQ, iQ5
|
|
E(96 well)
|
Biorad
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CFX96，DNA Engine opticon，opticon 2，Chromo4
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四．质量标准（QC）
1. biotnt gene qPCR array中检测的基因引物，经实验验证结果分析，融解曲线均呈单一锐锋，电泳条带均呈单一条带，说明这些引物均是特异扩增引物，验证合格。
2. PTC（阳性对照）反应孔，从融解曲线上分析均呈单一锐锋，从扩增曲线上分析，CT值介于18～22之间。
3. RTC（spike-in反转录对照）反应孔，从融解曲线上分析均呈单一锐锋，从扩增曲线上分析，CT值介于17～23之间。
4. HGDC 的CT 值应大于35，说明样本中没有基因组污染。
5. RTC和 PTC的三重复CT 值应比较接近，说明实验重复性好。
6. 板与板之间（批内）重复性达0.99以上，具有高度重复性。
五．基因（引物）排布 ：
每一个样本区里的基因排列如下：
|
1
|
2
|
3
|
4
|
5
|
6
|
7
|
8
|
9
|
10
|
11
|
12
|
|
A
|
基因1
|
基因2
|
基因3
|
基因4
|
基因5
|
基因6
|
基因7
|
基因8
|
基因9
|
基因10
|
基因11
|
基因12
|
|
B
|
基因13
|
基因14
|
基因15
|
基因16
|
基因17
|
基因18
|
基因19
|
基因20
|
基因21
|
基因22
|
基因23
|
基因24
|
|
C
|
基因25
|
基因26
|
基因27
|
基因28
|
基因29
|
基因30
|
基因31
|
基因32
|
基因33
|
基因34
|
基因35
|
基因36
|
|
D
|
基因37
|
基因38
|
基因39
|
基因40
|
基因41
|
基因42
|
基因43
|
基因44
|
基因45
|
基因46
|
基因47
|
基因48
|
|
E
|
基因49
|
基因50
|
基因51
|
基因52
|
基因53
|
基因54
|
基因55
|
基因56
|
基因57
|
基因58
|
基因59
|
基因60
|
|
F
|
基因61
|
基因62
|
基因63
|
基因64
|
基因65
|
基因66
|
基因67
|
基因68
|
基因69
|
基因70
|
基因71
|
基因72
|
|
G
|
基因73
|
基因74
|
基因75
|
基因76
|
基因77
|
基因78
|
基因79
|
基因80
|
基因81
|
基因82
|
基因83
|
基因84
|
|
H
|
HK1
|
HK2
|
HK3
|
GDC
|
GDC
|
GDC
|
RTC
|
RTC
|
RTC
|
PTC
|
PTC
|
PTC
|
& 基因引物：84个反应孔（从A排到G排）已预先交联好特异基因引物（详见基因引物列表）。
& HK1-3：3条已交联的管家基因(内参)引物，可作为array数据标准化过程中样品的阳性对照。
&GDC：基因组DNA对照，可用于qPCR反应体系中是否有基因组DNA污染。
& RTC：spike-in反转录对照，可用于检测RT反应的效率。这些已交联的引物可特异性扩增样品中外源性spike-in RNA反转录形成的cDNA模板。
& PTC：阳性PCR对照，已交联DNA阳性质粒模板，主要用于实时监测array反应板的PCR扩增效率。
基因引物列表
|
Symbol
|
GeneBank
|
|
基因1
|
Acaca
|
NM_022193
|
|
基因2
|
Acacb
|
NM_053922
|
|
基因3
|
Adipor1
|
NM_207587
|
|
基因4
|
Adipor2
|
NM_001037979
|
|
基因5
|
Adra1a
|
NM_017191
|
|
基因6
|
Adra1b
|
NM_016991
|
|
基因7
|
Adra1d
|
NM_024483
|
|
基因8
|
Adra2a
|
NM_012739
|
|
基因9
|
Adra2b
|
NM_138505
|
|
基因10
|
Adra2c
|
NM_138506
|
|
基因11
|
Ak1
|
NM_024349
|
|
基因12
|
Ak2
|
NM_030986
|
|
基因13
|
Ak3
|
NM_013218
|
|
基因14
|
Akt1
|
NM_033230
|
|
基因15
|
Akt2
|
NM_017093
|
|
基因16
|
Akt3
|
NM_031575
|
|
基因17
|
Atg13
|
NM_001271212
|
|
基因18
|
Cab39
|
NM_001106924
|
|
基因19
|
Camkk1
|
NM_031662
|
|
基因20
|
Camkk2
|
NM_031338
|
|
基因21
|
Chrna1
|
NM_024485
|
|
基因22
|
Chrnb1
|
NM_012528
|
|
基因23
|
Cpt1a
|
NM_031559
|
|
基因24
|
Cpt1b
|
NM_013200
|
|
基因25
|
Cpt1c
|
NM_001034925
|
|
基因26
|
Cpt2
|
NM_012930
|
|
基因27
|
Crtc2
|
NM_001033895
|
|
基因28
|
Cry1
|
NM_198750
|
|
基因29
|
Eef2k
|
NM_012947
|
|
基因30
|
Eif4ebp1
|
NM_053857
|
|
基因31
|
Elavl1
|
NM_001108848
|
|
基因32
|
Fasn
|
NM_017332
|
|
基因33
|
Foxo3
|
NM_001106395
|
|
基因34
|
Gpam
|
NM_017274
|
|
基因35
|
Gpat2
|
NM_001168529
|
|
基因36
|
Gys1
|
NM_001109615
|
|
基因37
|
Gys2
|
NM_013089
|
|
基因38
|
Hmgcr
|
NM_013134
|
|
基因39
|
Hnf4a
|
NM_022180
|
|
基因40
|
Insr
|
NM_017071
|
|
基因41
|
Lepr
|
NM_012596
|
|
基因42
|
Lipe
|
NM_012859
|
|
基因43
|
Mlycd
|
NM_053477
|
|
基因44
|
Mtor
|
NM_019906
|
|
基因45
|
Pdpk1
|
NM_031081
|
|
基因46
|
Pfkfb1
|
NM_012621
|
|
基因47
|
Pfkfb2
|
NM_080477
|
|
基因48
|
Pfkfb3
|
NM_057135
|
|
基因49
|
Pfkfb4
|
NM_019333
|
|
基因50
|
Pnpla2
|
NM_001108509
|
|
基因51
|
Ppargc1a
|
NM_031347
|
|
基因52
|
Ppargc1b
|
NM_176075
|
|
基因53
|
Ppp2ca
|
NM_017039
|
|
基因54
|
Ppp2cb
|
NM_017040
|
|
基因55
|
Ppp2r1a
|
NM_057140
|
|
基因56
|
Ppp2r1b
|
NM_001025418
|
|
基因57
|
Ppp2r2b
|
NM_022209
|
|
基因58
|
Ppp2r4
|
NM_001108577
|
|
基因59
|
Prkaa1
|
NM_019142
|
|
基因60
|
Prkaa2
|
NM_023991
|
|
基因61
|
Prkab1
|
NM_031976
|
|
基因62
|
Prkab2
|
NM_022627
|
|
基因63
|
Prkaca
|
NM_001100922
|
|
基因64
|
Prkacb
|
NM_001077645
|
|
基因65
|
Prkag1
|
NM_013010
|
|
基因66
|
Prkag2
|
NM_184051
|
|
基因67
|
Prkag3
|
NM_001106921
|
|
基因68
|
Prkar1a
|
NM_013181
|
|
基因69
|
Prkar1b
|
NM_001033679
|
|
基因70
|
Prkar2a
|
NM_019264
|
|
基因71
|
Prkar2b
|
NM_001030020
|
|
基因72
|
Rb1cc1
|
NM_001107901
|
|
基因73
|
Rps6kb1
|
NM_031985
|
|
基因74
|
Rps6kb2
|
NM_001010962
|
|
基因75
|
Rptor
|
NM_001134499
|
|
基因76
|
Slc2a4
|
NM_012751
|
|
基因77
|
Srebf1
|
NM_001276707
|
|
基因78
|
Stk11
|
NM_001108069
|
|
基因79
|
Strada
|
NM_182820
|
|
基因80
|
Stradb
|
NM_001109307
|
|
基因81
|
Tp53
|
NM_030989
|
|
基因82
|
Tsc1
|
NM_021854
|
|
基因83
|
Tsc2
|
NM_012680
|
|
基因84
|
Ulk1
|
NM_001108341
|